Υψηλότερο αρχικό κόστος: Σε σύγκριση με τα παραδοσιακά ηλιακά πάνελ ταράτσας, τα ηλιακά πλακάκια στέγης έχουν συχνά υψηλότερο αρχικό κόστος επένδυσης.
Ελαφρώς χαμηλότερη ενεργειακή απόδοση: Συνήθως, η απόδοση ενεργειακής μετατροπής των ηλιακών πλακιδίων στέγης μπορεί να είναι ελαφρώς χαμηλότερη από αυτή των τυπικών ηλιακών μονάδων.
Σπανιότητα Υπηρεσιών Εγκατάστασης: Επί του παρόντος, υπάρχουν σχετικά λίγες εταιρείες που παρέχουν υπηρεσίες εγκατάστασης ηλιακών πλακιδίων στέγης, κάτι που μπορεί να προκαλέσει κάποια ταλαιπωρία κατά τη διαδικασία εγκατάστασης.